咽畸胎瘤病因未明，可能与胚胎期生殖细胞异常分化等因素有关。畸胎瘤发源于多胚层组织的先天性肿瘤，应尽早手术切除。

手术宜在全麻下进行，以保证完整切除肿瘤和保持呼吸道的通畅。手术方式根据部位、大小不同而异，多数可采用经口径路。

良性畸胎瘤彻底切除肿瘤即可，无需其他的特殊处理，术后远期效果好，复发率低。恶性畸胎瘤则应按照恶性肿瘤的治疗原则，适当扩大切除的范围，术中根据病变的部位进行修复，并结合化疗，术后应注意随访。