孕三个月胎停育会出现自然流产的，但是可能会出现不全流产、妊娠物及其附属物等宫腔残留，容易导致大出血甚至失血性休克以及继发宫腔感染、粘连，甚至导致闭经、继发不孕等并发症。所以孕三个月胎停育出现自然流产，无论是否流干净，都需要及时复查。

如果发现宫腔残留，需要及时进行清宫术。因为如果胎停育时间较长，需要考虑稽留流产导致的残留组织致密粘连，容易出现凝血功能障碍，并且在清宫前需要备血以及预防感染。

所以怀孕前需要完善各项优生优育检查，并给予对症治疗，怀孕后定期到医院检查以降低风险。