功能性胃肠病的患者不建议吃大蒜，尤其是在急性期的时候。多是因为大蒜属于一种辛辣刺激性的食物，如果长时间大量地吃很有可能会导致胃部不适症状，也可能会使原有的症状进一步加重，还可能会增加胃黏膜、肠黏膜溃疡的几率。

另外，如果患有功能性胃肠病的患者无明显症状出现，可以少量地吃一些大蒜。大蒜当中含有大蒜素，对于杀灭胃肠道内的细菌也有一定的作用效果。

所以，患有功能性胃肠病的患者是否可以吃大蒜，要根据症状、病情等决定。