消化系统疾病、不良的生活饮食习惯，消化系统以外的疾病均可以引起消化不良。

多数患者出现消化不良，考虑和消化系统疾病有关，比如出现胃以及十二指肠的慢性疾病，如胃炎、胃溃疡、消化性溃疡，均会导致胃肠道的蠕动功能失调。食物摄入后还会增加胃肠道负担，可能引起消化不良。另外，长期不良的生活饮食习惯，比如不规律饮食、暴饮暴食，导致消化道负担加重，也是引起消化不良的主要原因。

除了消化系统疾病以外，糖尿病、充血性心率衰竭、心律失常、慢性肾功能不全、甲状腺功能亢进、硬皮病，等一些消化系统以外的疾病，也可能引起消化不良。需要到医院进行系统的检查，加以鉴别。