甲状腺功能亢进症是会引起肝功能指标异常的，这种情况一般发生在两种情况下：

1.由于甲状腺功能亢进症。本身是由于血中的甲状腺激素分泌增多，而导致的临床上出现的高代谢症候群的一种疾病，在肝脏也会表现为肝脏代谢的旺盛，进而会影响肝功能指标的异常。

2.由于甲亢的治疗有三种方法，其中之一就是服用抗甲亢的药物治疗，无论是甲巯咪唑还是丙硫氧嘧啶都有对于肝脏损伤的可能，也会导致肝功能指标的异常。所以在抗甲亢药物治疗之前，是常规需要化验肝功能再决定口服药的，而且在治疗过程中要监测肝功能的变化。