肾性失镁可以导致全身多个系统的并发症，低镁首先会出现消化系统的症状。患者可以出现恶心、呕吐的症状，有些患者可以表现为厌食。

其次是对神经系统的影响，镁离子在维持神经功能稳定方面，发挥着重要作用。当血液内镁离子降低时，会导致神经功能异常，患者可以出现表情淡漠。严重的患者可以出现肌肉抽搐、震颤，甚至发生癫痫。低镁还会影响心血管系统，低镁的患者容易发生心律失常，甚至会诱发恶性的心律失常。