对于急性的输尿管炎，常常伴随着其他的泌尿系统炎症，如肾盂肾炎和膀胱炎，其主要的检查方式是泌尿系彩超、泌尿系CT、血常规、尿常规检查、尿培养检查。

对于病毒感染性的输尿管炎诊断，主要是依赖于血清免疫学的检查，急性输尿管炎禁止行输尿管损伤性操作检查。

对于慢性输尿管炎的患者，除了可以依靠影像学的检查，如彩超和CT之外，还可以行输尿管镜检查，并且在输尿管镜下可留取组织学活检和病理切片，均有助于慢性输尿管炎的诊断，并且提供治疗依据。