维A酸类的软膏和抗病毒类的软膏，这些软膏可以促进扁平疣消除。也可以配合外用水杨酸，有一定的消炎杀菌的作用。同时，还可以根据症状服用一些中药进行调理。

对于局部比较明显比较大的扁平疣，还可以通过液氮冷冻或者激光手术的办法进行清除。还可以外用一些中药鸦胆子敷在上面，也可以促进扁平疣消退。平常一定要注意皮肤的清洁卫生，防止疾病复发。

在治疗的过程中，不要吃辛辣的食物。要注意多锻炼身体，增强免疫力，可以减少扁平疣复发的几率。