梅毒治疗两年多了，是否会影响怀孕，要依据治疗的效果判断。

如果经过正规的治疗之后，梅毒的滴度已经转呈阴性，单纯只是梅毒抗体阳性的情况下，是不影响怀孕的，这种情况梅毒已经治疗好了。如果梅毒治疗两年多了，但是滴度虽然有下降，但并没有完全转呈阴性的情况下则，有可能会导致胎传梅毒的概率。

所以建议在滴度没有完全转阴之前，怀孕的时候，可以选择在怀孕的第三个月和第七个月进行相应的梅毒阻断治疗，可以降低胎传梅毒的概率，能够避免新生儿出现先天梅毒的可能。