如果是初期的小儿肾结核，经过积极的抗结核治疗以后，治疗效果较好，大部分患儿都能够治愈。

如果是晚期的肾结核，即使进行了治疗，治疗效果可能也不太理想，还会引起一些并发症，会严重危害到小孩子的身体健康，影响到小孩子以后的生活质量。因此，在小儿出现肾结核疾病后，应尽早予以治疗，在早期主要是通过联合应用多种抗结核药物予以治疗，治疗周期一般为两年左右。

如果是晚期的肾结核，单侧的肾脏受损比较严重，结核病灶较多，在必要时可以将单侧的肾脏切除。