睾丸在阴囊内的位置异常，是导致睾丸扭转最常见的原因。睾丸系带过长以及睾丸发育不良，同样也是导致睾丸扭转的常见原因。

睾丸在阴囊内的位置没有固定，而是容易出现活动，这种情况下就会因为过度的活动或者位置不当，而导致睾丸扭转。典型的表现是在睡眠过程当中，突然出现一侧睾丸疼痛。

睾丸的体积过小或者睾丸精索过长，同样会导致睾丸的活动度增加，也是引起睾丸扭转的主要因素。睾丸扭转除了与自身因素有关之外，还可能与遗传因素有关，对有家族遗传史的病人，属于睾丸扭转的好发人群。