咽鼓管炎并不一定是单侧发病，也有可能是两侧同时发病的。

例如当患有鼻炎或鼻窦炎的患者，使用不正确的方式擤鼻涕的时候，导致鼻腔内的炎性分泌物进入到两侧的耳道，就有可能引发耳道两侧的咽鼓管炎。或者是在乘坐飞机的过程中，外界的压力会同时导致两侧耳道的压力失衡，此类情况引发的咽鼓管炎往往也是双侧同时发病。

但如果是腺样体肥大或者是肥厚性鼻炎引发的咽鼓管炎，肥大的鼻甲可能仅对单侧的咽鼓管口造成堵塞，此类情况会引发单侧的咽鼓管炎发病。