结肠瘘的并发症主要为腹腔及盆腔内感染、感染性休克、电解质紊乱、败血症、低蛋白血症、贫血等情况，严重可以导致死亡，结肠瘘属于腹腔内手术的并发症之一。

一般小的结肠瘘可以采取禁食水、胃肠减压、营养支持、抗感染及腹腔内放置引流管反复冲洗或可以得到好转。

但是对于较大的结肠瘘则是需要采取手术治疗，需要严重结肠瘘处采取结肠双腔造瘘，从而改善患者的疾病，减轻患者发生死亡的危险，结肠造瘘术后三个月恢复好后可以再次行结肠还纳术。