自体脂肪的后遗症主要在于随着体重的变化，脂肪填充的位置会发生明显的外形变化，比如体重上升的时候，填充的位置会明显地高于周围的组织。如果体重下降，这个位置会出现凹陷的变化。所以，求美者在进行脂肪填充之后，一定要对于相应的体重保持稳定的状态。

还有一种严重的后遗症，就是填充之后出现硬块、硬结的情况，主要是针对填充位置比较大或者是填充剂量比较多的部位，就会导致局部出现这种情况。硬块、硬结就要根据硬块、硬结的大小选择予以处理的方法是不同的，如果小的可以保持观察，大的硬块就需要手术的方法将其去除。

还有一种后遗症，就是在进行脂肪填充之后，由于这个位置的脂肪的厚度明显增加，在手感以及外观上可能多少会有一些臃肿和过于柔软的形态表现。