临床上对于结肠癌确切的发病机制，还没有完全明确。

但考虑结肠癌的发生、发展是由于多种致癌因素，综合作用于结肠黏膜使细胞发生增生，然后形成腺瘤样病变，再从腺瘤发展成过度失控增生，最终癌变形成结肠癌的原位癌。然后逐渐发展形成浸润癌，最终快速发展到晚期结肠癌。

致病因素中包括遗传因素、饮食因素、炎性因素、生活习惯因素，以及肥胖等其他致癌因素，都参与到结肠癌的形成过程中。这些多因素综合作用经历漫长的演变，最终形成结肠癌的肿瘤病变。