胎心、胎芽停止发育的原因，多考虑可能是胚胎基因缺失所引起。

由于胚胎自身存在基因缺失问题，无法使胎芽或胎心生长发育，就会导致胚胎停止发育的现象。也可能是由于孕妇患有某些疾病所引起，比如严重的肾脏疾病以及肝脏疾病，导致肝脏以及肾脏功能存在明显的异常，也会引起胚胎停止发育。

另外，还可能是由于受精卵形成时，卵子和精子存在染色体异常问题，致使胎儿出现染色体异常性疾病，进而造成胎心无法正常发育，出现胎心、胎芽停止发育的现象。