膝关节结核在严重时是需要手术。主要针对于药物治疗效果不佳，局部骨质出现坏死的患者。可进行滑膜切除术，将感染病灶清除。如果局部的骨质存在坏死，还应一并剔除坏死的骨质。

如果膝关节结核处于早期，骨质没有遭到破坏，可进行非手术治疗。对膝关节部位进行制动，限制膝关节的活动范围，长期应用抗结核药物控制。如果关节腔内的积液较多，还应当抽取关节腔积液，将积液抽出以后向关节内注入抗结核药物。

在治疗期间，还应当注意患者身体营养的补充，提高患者全身的抵抗力。