甲状腺全切除的后遗症，主要是会引起甲状腺功能减退。

甲状腺是合成和分泌甲状腺激素的一个腺体，当甲状腺被切除以后，甲状腺激素就会合成不足，患者就会出现原发性甲减的症状和体征。主要的表现就是低代谢的症状，可以有怕冷、嗜睡、乏困、反应迟钝、声音嘶哑、腹胀、便秘，甚至还可以出现麻痹性的肠梗阻。

长期未治疗的患者，还可以出现典型的颜面苍白，黏液水肿性的面容。另外，甲减还可以影响到女性的生殖系统，使患者出现经期延长，月经量过多等内分泌紊乱的情况。