龟头珍珠样丘疹可利用激光烧灼，或者是液氮冷冻方式将其去除。人为方式破坏珍珠疹，局部纤维填充愈合达到疹子去除的目的。

龟头部位的珍珠疹跟生理性变异有关，其发生存在一定的个体差异。可长时间存在，对日常生活以及工作无影响，可不用做任何治疗。经常用温热水清洗，做好性保护，避免不洁性行为即可。个体有强烈治疗意愿，可采取上述激光、冷冻方式治疗。

不洁性行为导致的尖锐湿疣，菜花样赘生物，跟珍珠疹外观类似，可辅助醋酸白试验进行鉴别诊断。