精子凝集患者可通过使用糖皮质激素类的药物进行治疗，比如强的松，能够有效地抑制抗精子抗体生成。

如果存在生殖系统感染性疾病，还应当通过口服抗生素类药物进行治疗，比如左氧氟沙星、阿奇霉素等。如果存在输精管堵塞的情况，应进行输精管吻合术或者是输精管疏通术。

如果使用药物治疗没有效果，还可以进行辅助生育，比如将精子表面的抗精子抗体去除后，进行人工授精。在治疗的过程当中，患者也不要存在过大的心理压力，注意身体卫生，清淡饮食，保证睡眠质量。