儿童含牙囊肿做手术，首先进行麻醉，之后进行切开，切开之后应该根据相应的手术部位，进行相应的手术的暴露视野，也就是进行牙龈的分离。

牙龈分离翻瓣之后可以去骨，去完骨之后可以看到含牙的囊肿，将牙齿和囊肿一并的摘除，然后再对相应的骨头进行治疗。含牙囊肿，它是属于典型的牙源性的颌骨囊肿，又叫做滤泡囊肿。它是发生于牙冠或者是牙根形成之后，缩余釉上皮与牙冠牙面之间出现的液体渗出，然后形成的，所以叫做含牙囊肿。

含牙囊肿可以是来自一个牙胚，也就是含一颗牙，也有可能是来自多个牙胚，也就是含多颗牙的囊肿。