咽肌麻痹并发症容易导致舌咽神经损伤。咽肌麻痹可分为完全性或不完全性，单侧或双侧性。单侧麻痹常无症状，双侧麻痹症状则较重。

由于软腭麻痹，鼻咽不能闭合，患者说话有开放性鼻音，进流质饮食时易返流于鼻腔，进食固体食物则影响不大。

针对病因治疗，中枢性者请内科、神经科协同诊治。对于周围性麻痹患者，可用抗胆碱酯酶药或神经兴奋剂、维生素类药物治疗，并可进行针灸治疗。咽缩肌麻痹不能进食或有误吸者应插鼻胃管。