女性会得甲状腺癌的原因目前还不是很清楚。通常认为分化性甲状腺癌，也就是乳头状腺癌和滤泡状癌，主要与放射线、甲状腺腺叶切除、碘缺乏、抗甲状腺药物的应用等有关。

如果女性在幼年时期曾经接受过头颈部放射线照射治疗，经过多年后就可能会导致甲状腺癌的发生。还有一部分成年女性患有毒性甲状腺肿，在治疗过程中可能会使用碘-131的放射治疗，也是有可能增加甲状腺癌的发病风险。

除分化性甲状腺癌外，甲状腺髓样癌的发病通常认为具有一定的家族遗传性。而一部分甲状腺未分化癌可能来自分化性乳头状腺癌和滤泡状癌。