先天性心脏病是否采取药物治疗，视具体病情以及家属充分知情后的考虑。

药物治疗主要包括改善心脏功能的治疗，比如随着年龄的增长，疾病的发展，部分先天性心脏病患者的心脏功能降低，需给予强心利尿药物，如地高辛、呋塞米。

部分患者合并心跳加快症状，此时可采用减慢心率的药物，如倍他洛克。还有部分患者因心脏结构畸形，较容易形成血栓，所以需使用预防血栓的药物，比如阿司匹林、华法林等。