注射流感疫苗的不良反应与其他的疫苗基本类似，常见的不良反应包括：

1.全身的不良反应。有低热，一般在注射后6小时到24小时之间可以出现低烧。一般体温在37.5℃左右，很少超过38℃。一般不需要特殊处理，多数在2~3天可以恢复到正常。发热的同时可以伴有全身的不适症状，比如出现乏力、头痛、肌肉关节酸痛。

2.出现消化道的症状。表现为恶心、呕吐或者出现腹泻。

3.表现为局部的不良反应。出现注射部位的疼痛、红肿，甚至出现硬结。有些可以出现局部的淋巴结的肿大。

4.可以出现过敏反应。表现为荨麻疹，也可以出现血管神经性水肿，可以服用抗过敏的药物治疗。