有一部分儿童颅内肿瘤是先天性的。

有些患者的肿瘤和遗传有关，家族中存在致病基因，比如视网膜母细胞瘤、神经纤维瘤等，孕妇在怀孕期间如果接触放射线，也可以诱发胎儿发生颅内肿瘤。有些患儿颅内肿瘤是胚胎时期的残余物质导致，比如颅咽管瘤、畸胎瘤等，这些因素导致的肿瘤在胎儿出生时就已经存在，患儿早期可能没有明显的症状，随着肿瘤的逐渐增大，患儿的症状会逐渐的出现。

儿童颅内肿瘤的种类很多，有些肿瘤是后天出现。