婴儿喉咙有痰是否会自愈，要具体情况具体分析。因为有一些小儿喉咙偶尔晨起出现痰液，情况不严重，家长可以进行拍打背部，促进痰液排出，此时是可以自愈的。

但是也有一些病理性的因素，如细菌或病毒感染后而出现痰液，此时自愈概率不大，需要在医生的指导下进行处理。

因为小儿的咳嗽反应比较弱，如果痰液没有及时的排出，可能会增加病原体感染的几率，持续时间越长，症状会越严重，甚至还会影响小儿的生长发育，所以家长要引起重视。