卵巢恶性肿瘤以上皮性恶性肿瘤为主，也就是卵巢癌最为常见。尽管常被称为上皮细胞肿瘤，但是卵巢肿瘤的这个胚胎学主要来源于中胚层及卵巢的腹膜面。

尽管认为卵巢排卵后，上皮下包涵囊肿是发生异型改变的起始病灶。但后来根据研究表明，输卵管纤毛可能是50%以上肿瘤的起源部位，原发性的腹膜癌和输卵管癌较为罕见，其生物学行为和治疗同卵巢癌。卵巢癌的恶性肿瘤，它主要的转移途径为依靠平移播散至沿盆腔脏器脱落癌细胞随着腹水循环播散至全腹。癌细胞还可通过淋巴或者血液途径转移。卵巢癌触摸外转移较少见。但随着越来越多的这个患者生存时间的延长，多达40%的病例在疾病的晚期出现了肝脏、肺脏以及中枢神经系统的转移。