肺栓塞治愈以后还是有可能复发，肺栓塞经过积极的抗凝和或溶栓的处理以后，使其得以治愈。但如果患者深静脉血栓形成的危险因素短时间内难以去除时，肺栓塞是有一定的复发率，特别是先天性或遗传性因素导致的易栓症的患者，他们很容易出现肺栓塞的复发。

部分后天获得的危险因素难以去除，或再次出现深静脉血栓形成的危险因素时，可导致肺栓塞复发，特别是某些慢性基础疾病难以治愈时，例如心房纤颤、恶性肿瘤、糖尿病等。

故为了预防肺栓塞的复发，通常根据其危险程度采取不同疗程的抗凝治疗，以降低其复发率，部分栓塞危险因素持续存在者，例如恶性肿瘤、易栓症的患者，多需要终身的抗凝治疗。