正常情况下，下生殖道中尤其阴道内寄居者不同种类和数量的菌群，本质上属于体内的内源性微生物。主要有乳酸杆菌、消化链球菌、葡萄球菌、加德纳菌、支原体等等。其中乳酸杆菌是阴道内健康生态系统中的优势菌，维持阴道的微生态平衡。当体内免疫功能受损，菌群出现紊乱，妊娠或大量使用抗生素，或者有侵袭性操作时。菌群可在体内定植繁殖，引起疾病。在治疗上需要根据分泌物涂片及药敏试验对症治疗，不同阴道炎分型，治疗方案也是不同的。滴虫性和细菌性阴道炎可以口服甲硝唑片，霉菌性阴道炎，可以用咪康唑类，制霉菌素类或克霉唑类的栓剂治疗。