扁桃体肥大的主要原因有以下几个：

1.生理性肥大。因为孩子生长发育比较快，其淋巴系统增生也快，双侧腭扁桃体生理性肿大，一般都处于一度和二度。如果生理性扁桃体肿大处于三度，就会占据咽部大量空间，从而导致进食困难、夜间睡眠张口呼吸、打呼噜，严重的患者无法平卧睡觉，需要及时做扁桃体、腺样体切除手术。

2.上呼吸道感染而导致的扁桃体反复感染，从而引起扁桃体炎症性增生、肿大。这样的扁桃体隐窝里面会有大量的细菌、病毒。在机体免疫力下降的时候就会感染，出现咽部疼痛、扁桃体化脓、高热等症状。