生殖器疱疹与梅毒都属于性病的一种，都是可以通过性生活传播而引起的一类疾病，但是两者的病原体以及疾病的症状及治疗的方法都是完全不同的。

生殖器疱疹是由于感染单纯疱疹病毒二型而引起的病毒性的皮肤病，而梅毒是由于感染了梅毒螺旋体而引起的一类性传播疾病。生殖器疱疹最典型的症状就是在生殖器部位出现片状红斑，上面有簇集性的疱疹和小水泡，并且容易糜烂。

而梅毒最典型的症状就是在生殖器部位出现硬溃疡，一般不痛不痒。在治疗方面，生殖器疱疹是以抗病毒治疗为主，而梅毒是打青霉素针剂。