脑炎的患者建议暂时不要注射新冠疫苗。主要原因有以下两种：

一、当发生脑炎的时候，主要的病因包括细菌、病毒、支原体、隐球菌等。发病的时候人体会伴有认知、运动、感觉等方面的功能障碍，人体的免疫力低下。这时如果注射新冠疫苗后，产生抗体的可能性较小，达不到预防本病的目的。有的患者会伴有不同程度的认知功能障碍，注射疫苗后不能反馈所产生的副作用，可能会给人体造成伤害。

二、当脑炎发作的时候，可能会使用一些糖皮质激素或免疫抑制剂，会使人体的免疫功能进一步下降。所以当脑炎发作时，不建议注射新冠疫苗。