脑脓肿是会引起头疼的。脑脓肿多是因为致病菌侵入颅内，而引起颅内感染，并且形成脓肿，而引发的相应的神经功能障碍的疾病。脑脓肿以后会出现高热、头痛、呕吐、肢体偏瘫、癫痫，以及意识障碍等相应的一些并发症。脑脓肿引起的头疼的原因包括如下：

第一，颅内的各种致病菌产生的炎性因子以及毒性侵袭、刺激硬脑膜处神经，而出现剧烈头疼的现象。

第二，颅内的炎症以及脑脓肿形成的占位效应，以及水肿形成颅内压的增高明显。颅腔容量是固定不变的，脑组织受压以后，会引起患者出现头疼、呕吐、肢体偏瘫、癫痫等症状。

脑脓肿患者出现头疼，首先要给予抗感染以及脱水、利尿等处理。对于形成的脑脓肿是否需要行手术摘除，或者是穿刺引流，要根据脑脓肿的大小、脓肿的部位、脓肿是单发或是多发，以及是否引起神经功能的障碍决定进一步的治疗方式。