服用阿莫西林后有可能出现的不良反应，最常见为消化道症状，比如有的患者用药后，可引起恶心、反胃、呕吐、腹泻、腹胀等。还有可能引起药物过敏反应，比如起皮疹、荨麻疹、皮肤瘙痒、引发哮喘等。

阿莫西林使用中有可能出现的不良反应，还包括血液系统的异常，比如血小板减少、贫血、嗜酸性粒细胞增多等，并有可能引起中枢神经系统症状，表现为失眠、焦虑、兴奋、头晕等。

除此之外，阿莫西林的不良反应，还可引起假膜性肠炎，也可造成二重感染。