新生儿低血糖症会出现惊厥的表现，需要和新生儿低钙血症相鉴别，新生儿低钙血症可伴有低血糖的情况，表现为惊厥、惊跳，喉痉挛等。查血清钙＜1.8mmol/L，血清游离钙＜0.9mmol/L可诊断为新生儿低钙血症。新生儿缺血缺氧性脑病也可以出现原始反射减退，容易惊厥，头部颅脑超声检查，颅脑核磁共振可显示缺血缺氧的表现。新生儿化脓性脑膜炎也可以有惊厥表现，伴有前囟门饱满，继发于感染性疾病，脑脊液检查可有特异性改变。