影响新生儿听力筛查没有通过的原因很多，常见的有生理原因，比如新生儿出生以后外耳道里的羊水胎脂等一些残留物。在检测之前没有及时清理，导致耳声发射的传入刺激声和传输出的信号减弱或消失，从而影响了耳声发射引出信号的减弱、消失，导致结果出现假阳性。这种情况可以等出生48小时以后再进行听力测试，胎脂都会吸收，也可以用棉棒清洁外耳道以后再测试。

如果新生儿患有感冒、流涕或者喉喘鸣等情况，以及在清醒状态下比较烦躁、多动，也会影响听力筛查的结果，等孩子症状消失以后再进行检测。

新生儿中耳积液也是其中的一项干扰因素，多数积液在3个月以后吸收，这时候的筛查试验会转为阴性。