新生儿先天的食管闭锁，主要是以下这些原因所导致的：

一、在胚胎发育时期出现胚胎发育畸形时，会导致胚胎发育异常。新生儿出生之后，就可能会患上这种疾病。

二、在怀孕的过程中，孕妇没有做好相关的防护措施和调节，会导致胚胎的发育受到影响，会引起本病的发生与发展。

新生儿在出生之后，确诊患有先天性食管闭锁疾病时，要及时采取治疗措施。及时采取合理的治疗，能够防止对患儿的身体造成严重的损害。治疗不当不仅会导致疾病加重，也会影响患儿的生命安全。