甲状腺功能减退症的女性患者若是未经治疗，所孕育的婴儿出现缺陷的风险也更高，相对正常孕妇所生的孩子更容易出现智力障碍以及发育的问题，但是具体的数据目前暂无统计。

然而甲状腺功能减退的患者若是补充碘和左甲状腺素，可正常的孕育健康胎儿，可不影响胎儿自身的甲状腺素合成，因此也可以不影响胎儿的生长发育。

值得注意的是甲状腺激素的水平若是太低，也会干扰女性患者的排卵，从而影响患者的孕育能力，倘若患者是因为自身免疫性疾病导致的甲减，也可能干扰女性的生育能力。