早上眼睛会疼可能有以下几点原因：

1.睡觉的姿势不正确，长期压迫到眼部，导致眼部的血液循环发生障碍。

2.前一天晚上睡前玩手机，或者是看电视的时间过长，导致眼睛过度疲劳。

3.熬夜后，自身抵抗力下降，导致眼部出现麦粒肿，或者是眼部炎症等。

4.早上眼睛受到较强的光线刺激。

5.前一天晚餐时饮食不当，对眼部产生刺激，继而出现疼痛。

6.平时眼部较为干燥，有少数干眼症的患者，在晨起的时候会出现眼睛疼。

7.临床上有部分患者血压或者是颅内压过高的时候，也会出现早上眼睛疼的情况发生。

这些都可能与早上眼睛疼有一定的关系。