自主性高功能甲状腺腺瘤的治疗，主要还是要针对它的高功能进行治疗，也就是针对甲亢进行治疗。可以选择抗甲状腺药物治疗、碘131治疗，或者是手术治疗。但是抗甲状腺药物治疗复发的几率比较大。如果选择碘131治疗的话，同位素碘容易聚集在高功能的腺瘤处。所以对于这种患者，可以选择碘131治疗，一般效果也会比较好。除此以外，如果腺瘤比较大，出现压迫性的症状，还可以选择手术治疗，进行局部的腺瘤切除手术。