手术治疗肛周脓肿非常有效，肛门周围脓肿切开引流术是临床上采用最多的方式。肛门直肠周围脓肿多继发于肛窦隐窝感染、直肠损伤，也见于结核病、糖尿病、溃疡性结肠炎的患者。

脓肿的治疗包括综合治疗和手术治疗。综合治疗包括消除病因，积极控制血糖，治疗肠炎，保持良好的饮食习惯，避免大便干燥，多食用粗纤维食物、蔬菜、水果，杜绝烟酒和辛辣食物。

手术治疗在脓肿确诊之后马上实施引流脓液，解除脓腔压力，缓解疼痛，避免炎症进一步扩散蔓延是临床上行之有效的手段。