大多数的肛门血栓会自己消掉，肛门局部形成血栓又可称为血栓性外痔，属于外痔中的一种类型，也属于外痔的急性发作。是由于肛门皮肤下的血管内血栓形成或者由于血管破裂，血液淤积于肛门周围皮下所导致的。

大多数的肛门血栓会在发生后1~2周消掉，如果患者能配合使用痔疮膏、坐浴等治疗方法，可以加速血栓消掉，少部分患者血栓不能自己消掉。即使通过使用药物也无法消除，时间久了血栓就有可能会出现肌化而形成皮下结节。结节一般不会出现什么临床症状，如果想其完全消除，可能只有通过手术切除。