新生儿甲状腺功能低下，要在医生的指导下采取以下这些治疗措施：

首先，有此种现象时，要在医生的指导下来服用甲状腺激素药，严格遵医嘱服用这类药物，才能改善甲状腺功能低下的现象。在服用此药物的过程中，要定期进行甲状腺功能的检查。

出现甲状腺功能低下时也会伴随着一些明显的不适症状，此时的情绪会发生较大的变化，要安抚好患儿的情绪，才有利于疾病的治疗。

新生儿有甲状腺功能低下，一定要尽早的采取治疗，因为没有及时救治，影响到新生儿的智能发育，会导致新生儿出现骨骼发育迟缓，和身高发育缓慢的现象。