病毒性心肌炎可以由多种病毒引起的，比如柯萨奇B组病毒、人疱疹病毒6型、ECHO病毒、脊髓灰质炎病毒、细小病毒B19等。其中最常见的还是柯萨奇B组病毒，它的致病率可以达到50%。

还有一些不太常见的人类腺病毒、流感病毒、单纯疱疹病毒、A型肝炎病毒、B型肝炎病毒、C型肝炎病毒、风疹病毒、脑炎病毒、EB病毒、巨细胞病毒、人类免疫缺陷病毒等也可以引起心肌炎。

要明确是哪一种病毒，需要结合患者的病史以及进行心肌细胞内病毒、病毒抗原、病毒基因片段或病毒蛋白的化验来明确诊断。