习惯性流产可分为早期习惯性流产和晚期习惯性流产。

早期习惯性流产，常见的原因为胚胎染色体异常，包括染色体结构异常和数目异常，或者孕妇合并有免疫功能异常、内分泌紊乱疾病，如黄体功能不全、甲状腺功能低下、多囊卵巢综合征、高泌乳素血症等。另外，孕妇有糖尿病，孕期血糖未控制，或者孕妇长期吸烟、酗酒，或者接触放射线毒物，或者男方精子染色体异常，或者畸形精子等，是导致习惯性流产的原因。

晚期复发性流产，常见的原因为子宫解剖的异常。如宫颈肌能不全、多囊卵巢综合征、宫腔多囊卵巢综合征多囊卵巢综合征、高泌乳素血症等。另外，孕妇有糖尿病，孕期血糖未控制，孕妇长期吸烟、酗酒，接触放射线毒物，男方精子染色体异常，畸形精子等，是导致习惯性流产的原因。

晚期复发性流产，常见的原因为子宫解剖的异常。如宫颈肌能不全、纵隔子宫、宫腔纵隔子宫、子宫腺肌症等，或者自身免疫异常、抗磷脂抗体多囊卵巢综合征等，还有部分是原因不明的习惯性流产妇女。