肌钙蛋白主要存在于心肌细胞内，当心肌细胞出现坏死时，肌钙蛋白就会释放到血液中，所以肌钙蛋白临床上，常常用来评估心脏的损伤。

最常见的应用方法就是用来诊断早期的急性心肌梗死，尤其对于有胸痛的患者进行鉴别诊断最有意义，能够排除急性的心肌梗死。肌钙蛋白在心肌梗死后三小时，就能在血液中检测出，肌钙蛋白是诊断急性心肌梗死的金标准。

但是有些自身免疫性的疾病，甲状腺的疾病也有可能出现肌钙蛋白的升高，所以要结合临床症状。