子宫内膜异位症，少部分可以自愈。对于症状比较轻或者没有临床症状的子宫内膜异位症，尤其是没有形成，卵巢子宫内膜异位囊肿，也就是巧克力囊肿，只是有局部的内膜异位症结节的病人。经过妊娠和哺乳期一年多的时间，可以由于激素水平受到抑制，内膜异位病灶不会持续的出血。在这段时间，有可能会逐渐的吸收，直到消失，因此轻症的病人有可能会自然痊愈。

但是，大多数的子宫内膜异位症，尤其是有深部浸润型的子宫内膜异位症，以及卵巢子宫内膜异位囊肿。这样比较严重症状的内膜异位证，大多数是不能自愈的。要通过药物治疗或者是手术治疗，而且在治疗之后，还有一定的比例会出现复发。

因此，对于有生育要求的，子宫内膜异位症的病人，建议尽快怀孕。因为怀孕，不仅可以缓解症状，还可以在一定程度上，使子宫内膜异位症自然痊愈。