尖锐湿疣的治疗是一个综合性的治疗，既需要抗病毒，去除疣体，也需要提高全身的免疫力。

药物治疗可以选用0.5%的鬼臼毒素酊，适用于治疗直径小的疣体，临床治愈率可高达90%左右。冷冻治疗，利用低温的液氮治疗尖锐湿疣，促进疣组织坏死脱落。激光治疗，通常用二氧化碳激光，采用烧灼法治疗尖锐湿疣，对单发或少量多发疣体可进行一次性治疗。手术治疗，适用于巨大尖锐湿疣，对疣体整个或分批切除。

可以静脉输入复方甘草酸苷注射液，同时局部注射干扰素进行治疗，提高机体的免疫力，减少尖锐湿疣的复发。