脑型血吸虫病主要以脑膜炎的症状为主，患者多出现发热的症状，可伴头痛、恶心、呕吐，有些部位的脑组织受损可以导致患者出现癫痫的症状，有些患者可以发生肢体瘫痪，有些患者会出现不同程度的意识障碍。

脑型血吸虫还可以导致脑动脉发生栓塞，患者可表现为突然的肢体瘫痪，部分患者伴有失语。

脑型血吸虫会沉积在脑组织内，诱发脑组织的炎症，患者的症状和脑组织的损害程度和部位有关，脑组织损害越严重，患者的临床表现越严重。